GÜNGÖR BUDAK

Seven Bridges'te Biyoenformatik Uzmanı & ODTÜ'de Doktora Öğrencisi

Hakkımda

Hizmetler

Serbest biyoenformatikçi ve web geliştirici / programcı olarak çalışıyorum ve çeşitli biyoenformatik işleri / projelerinde yer aldım ve çeşitli web uygulamaları ve web siteleri geliştirdim. Lütfen daha fazla bilgi için Hakkımda ve Araştırma sayfalarını ziyaret edin. 6 yıldan fazla biyoenformatik tecrübesi ve 12 yıldan fazla web geliştirme / programlama tecrübesine sahibim.

Biyoenformatik Hizmetleri

  • Veri analizi (RNA-seq, ChIP-seq, genomik, proteomik)
  • Ağ modelleme, analizi, görüntüleme
  • Fonksiyonel zenginleştirme, gen seti zenginleştirme analizi
  • Dizi ve yapı hizalama, filogenetik ağaç oluşturma

Web Geliştirme ve Programlama Hizmetleri

  • Web site tasarımı ve web programlama
  • Arama motoru optimizasyonu (SEO)
  • Sosyal medya (Facebook, Twitter, Google+) entegrasyonu
  • İçerik yönetim sistemleri (CMS) kurulumu ve özelleştirme (Drupal & Wordpress)

Beceriler

İyi hizmetler sunabilmek için durmadan öğrendim ve kendimi biyoenformatik ve web geliştirme / programlama alanlarında geliştirdim. Aşağıda, edindiğim bazı becerilerden bahsediyorum.

Biyoenformatik Becerileri

  • FASTX Toolkit, SAMTools
  • BLAST, BWA, HISAT, STAR, TopHat hizalayıcıları
  • StringTie, Cufflinks
  • Numpy, Scipy, Matplotlib, BioPython
  • Ensembl BioMart, Ensembl API’ları
  • Cytoscape, PathVisio, NetworkX
  • Chimera, Autodock4

Web Geliştirme ve Programlama Becerileri

  • HTML, CSS, JavaScript, jQuery, AJAX
  • Python, R, Java, C, Perl, PHP, MySQL
  • Laravel 4, Drupal, Wordpress, Django Web Framework
  • React.js, Bootstrap
  • Android uygulama & Wordpress eklenti geliştime
  • Git, svn versiyon kontrol
  • Adobe Photoshop, Adobe Illustrator

İşler

Önceki biyoenformatik ve web geliştirme ve programlama işlerim burada tanımlarıyla birlikte listeleniyor.

Bana iş verin

İşleriniz ve projelerinizde bana iş vermek için Upwork profilimi ziyaret edin ya da İletişim sayfasından bana ulaşın.

Biyoenformatik

Prescr (2015)
Hasta adının girilebildiği, otomatik tamamlayan açılır kutu ile reçete oluşturulabildiği ve reçetelerin PDF olarak kaydedilebildiği küçük uygulama (Java/Swing)

TraceGadget (2015)
ABI format dosyalarından elde edilen dizileri referans genom veritabanına blastlayarak ya da ilgili referans genomuna hizalayarak, bu dizilerde olası mutasyonların tespiti (Python/Tkinter)

Maksimum Olabilirlik yöntemi ile Filogenetik Analiz (PAML) (2015)
Dizileri tespit eden, onları GO’ya göre kategorilere ayıran, her genin ortologlarını bulan, ortologların dizilerini getiren, bunları hizalayan ve PAML’ı çalıştıran bir yazılım geliştirme.

Fragman Üretici (2014) Moleküler biyoloji ya da genetik uygulamaları için diziyi (çoğunlukla ekson) alarak istenen boyutta fragmanlar üreten küçük bir Python yazılımı.

Web Geliştirme ve Programlama

tummyapp.com (2017)
React.js, React Router ve create-react-app ile hazırlanmış tek sayfa uygulaması. Algolia anında arama entegrasyonu ve Firebase veritabanı. Bootstrap 3 CSS ve JS yapısı.

angorakizogrenciyurdu.com (2015)
Yalnız PHP basit dinamik web site, Bootstrap 3 CSS ve JS yapısı. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

fiberacil.com (2014)
Yalnız PHP basit tek sayfa web site, Bootstrap 3 CSS ve JS yapısı. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

mikronet.net (2014)
Wordpress web site eklentilerle kişiselleştirilmiş, Responsive alt teması ve iki eklenti Shouty ve Slidy geliştirildi. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

ucelelektrik.net (2013)
Yalnız PHP basit dinamik web site. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

a1almanca.com (2012)
Drupal web site eklentilerle kişiselleştirilmiş. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

evrimagaci.org (2011)
Laravel 4 uygulaması, Bootstrap 3 CSS ve JS yapısı. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.

altingecit.com (2010)
Drupal web site eklentilerle kişiselleştirilmiş, ve PHP, MySQL ve AJAX teknolojileri ile canlı destek sistemi. SEO ve sosyal medya entegrasyonu.