Below you will find pages that utilize the taxonomy term “2016”
Blog
Computing Significance of Overlap between Two Sets using Hypergeometric Test
There are many cases where we have two sets (e.g. under two different conditions) of things such as transcripts, genes or proteins and we want to compute the significance of the overlap between them. Hypergeometric test is very simple and widely used option for such cases.
I’ll use the phyper function in R but you can use the same idea in SciPy (Python).
Let’s say you have from 200 genes (A);
Blog
ODTÜ Enformatik Enstitüsü'nün 20. Yılı Etkinliği
ODTÜ Enformatik Enstitüsü kuruluşunun 20. yılını bir bilim festivaliyle kutluyor. 16 Mayıs 2016‘da, ODTÜ Kültür ve Kongre Merkezi’nde gerçekleştirilecek olan bilim festivaline herkes davetlidir!
Bilime, sanat ve müziğin de eşlik edeceği bu festivalde aşağıdaki ana konuşmacılar yer alacaktır:
Prof. Dr. Jennifer Hayes: New England Microsoft Araştırma ve New York Microsoft Araştırma yönetici ve eş kurucu Assoc. Prof. Claudio Ferretti: Milano-Bicocca Üniversitesi, Bilgisayar Bilimi, Sistemleri ve İletişimi Dr. Christian Borgs: Araştırmacı, New England Microsoft Araştırma vekil yönetici ve eş kurucu Etkinliğin Facebook sayfasına gitmek için tıklayın.
Blog
Mann Whitney U Test (Wilcoxon Rank-Sum Test) Javascript Implementation
Currently Javascript is really poor in statistical methods compared to Python (SciPy) and R. There are several efforts to fill this gap, most notably from jStat. However, still many functions, distributions and tests are missing in this library. In one of my projects, I had to implement a Javascript version of Mann Whitney U test (or also called Wilcoxon rank-sum test). Here, I’m giving a link to its source code and describing how it works.